프로젝트 .settings 디렉토리의 org.eclipse.wst.common.project.facet.core.xml 를 수동으로 수정하면된다.
확인 : 이클립스의 프로젝트명 위에서 오른클릭 > properties > Project Facets

1. 이클립스 종료
2. PROJECT_NAME/.settings/org.eclipse.wst.common.project.facet.core.xml 을 편집기로 Open 한다.

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<faceted-project>
  <fixed facet="jst.web"/>
  <fixed facet="jst.java"/>
  <installed facet="jst.java" version="1.8"/>
  <installed facet="jst.web" version="2.5"/>
</faceted-project>

3. 수정 후 이클립스를 실행한다.
4. Project > clean
5. Server를 시작한다.